Protein–RNA interactions for Protein: A2AGU5

Cldn34d, Claudin 34D, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34dA2AGU5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cldn34dA2AGU5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cldn34dA2AGU5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cldn34dA2AGU5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cldn34dA2AGU5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cldn34dA2AGU5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cldn34dA2AGU5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cldn34dA2AGU5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cldn34dA2AGU5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cldn34dA2AGU5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cldn34dA2AGU5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cldn34dA2AGU5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cldn34dA2AGU5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cldn34dA2AGU5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cldn34dA2AGU5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cldn34dA2AGU5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cldn34dA2AGU5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cldn34dA2AGU5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cldn34dA2AGU5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cldn34dA2AGU5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cldn34dA2AGU5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn34dA2AGU5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn34dA2AGU5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn34dA2AGU5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cldn34dA2AGU5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cldn34dA2AGU5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cldn34dA2AGU5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Cldn34dA2AGU5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cldn34dA2AGU5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cldn34dA2AGU5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cldn34dA2AGU5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cldn34dA2AGU5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cldn34dA2AGU5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cldn34dA2AGU5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cldn34dA2AGU5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cldn34dA2AGU5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cldn34dA2AGU5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cldn34dA2AGU5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cldn34dA2AGU5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cldn34dA2AGU5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn34dA2AGU5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn34dA2AGU5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn34dA2AGU5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn34dA2AGU5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn34dA2AGU5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn34dA2AGU5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn34dA2AGU5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn34dA2AGU5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn34dA2AGU5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn34dA2AGU5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn34dA2AGU5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn34dA2AGU5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn34dA2AGU5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn34dA2AGU5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn34dA2AGU5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn34dA2AGU5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn34dA2AGU5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn34dA2AGU5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Cldn34dA2AGU5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cldn34dA2AGU5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cldn34dA2AGU5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cldn34dA2AGU5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cldn34dA2AGU5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cldn34dA2AGU5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn34dA2AGU5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn34dA2AGU5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn34dA2AGU5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn34dA2AGU5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn34dA2AGU5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn34dA2AGU5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn34dA2AGU5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn34dA2AGU5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn34dA2AGU5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn34dA2AGU5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn34dA2AGU5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn34dA2AGU5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn34dA2AGU5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn34dA2AGU5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn34dA2AGU5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cldn34dA2AGU5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Cldn34dA2AGU5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cldn34dA2AGU5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cldn34dA2AGU5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cldn34dA2AGU5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cldn34dA2AGU5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cldn34dA2AGU5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cldn34dA2AGU5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cldn34dA2AGU5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cldn34dA2AGU5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cldn34dA2AGU5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cldn34dA2AGU5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cldn34dA2AGU5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cldn34dA2AGU5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cldn34dA2AGU5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cldn34dA2AGU5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cldn34dA2AGU5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cldn34dA2AGU5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cldn34dA2AGU5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cldn34dA2AGU5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cldn34dA2AGU5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.6 ms