Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Frmpd4A2AFR3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Frmpd4A2AFR3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Frmpd4A2AFR3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Frmpd4A2AFR3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Frmpd4A2AFR3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Frmpd4A2AFR3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Frmpd4A2AFR3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Frmpd4A2AFR3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Frmpd4A2AFR3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Frmpd4A2AFR3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Frmpd4A2AFR3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Frmpd4A2AFR3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Frmpd4A2AFR3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Frmpd4A2AFR3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Frmpd4A2AFR3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Frmpd4A2AFR3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Frmpd4A2AFR3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Frmpd4A2AFR3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Frmpd4A2AFR3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Frmpd4A2AFR3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Frmpd4A2AFR3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Frmpd4A2AFR3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Frmpd4A2AFR3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Frmpd4A2AFR3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Frmpd4A2AFR3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Frmpd4A2AFR3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Frmpd4A2AFR3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Frmpd4A2AFR3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Frmpd4A2AFR3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Frmpd4A2AFR3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Frmpd4A2AFR3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Frmpd4A2AFR3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Frmpd4A2AFR3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Frmpd4A2AFR3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Frmpd4A2AFR3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Frmpd4A2AFR3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Frmpd4A2AFR3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Frmpd4A2AFR3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Frmpd4A2AFR3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Frmpd4A2AFR3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Frmpd4A2AFR3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Frmpd4A2AFR3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Frmpd4A2AFR3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Frmpd4A2AFR3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Frmpd4A2AFR3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Frmpd4A2AFR3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Frmpd4A2AFR3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Frmpd4A2AFR3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Frmpd4A2AFR3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Frmpd4A2AFR3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Frmpd4A2AFR3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Frmpd4A2AFR3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Frmpd4A2AFR3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Frmpd4A2AFR3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Frmpd4A2AFR3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Frmpd4A2AFR3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Frmpd4A2AFR3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Frmpd4A2AFR3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Frmpd4A2AFR3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Frmpd4A2AFR3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Frmpd4A2AFR3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Frmpd4A2AFR3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Frmpd4A2AFR3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Frmpd4A2AFR3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Frmpd4A2AFR3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Frmpd4A2AFR3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Frmpd4A2AFR3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Frmpd4A2AFR3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Frmpd4A2AFR3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Frmpd4A2AFR3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Frmpd4A2AFR3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Frmpd4A2AFR3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Frmpd4A2AFR3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Frmpd4A2AFR3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Frmpd4A2AFR3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Frmpd4A2AFR3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Frmpd4A2AFR3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Frmpd4A2AFR3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Frmpd4A2AFR3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Frmpd4A2AFR3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Frmpd4A2AFR3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Frmpd4A2AFR3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Frmpd4A2AFR3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Frmpd4A2AFR3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Frmpd4A2AFR3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Frmpd4A2AFR3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Frmpd4A2AFR3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Frmpd4A2AFR3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Frmpd4A2AFR3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Frmpd4A2AFR3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Frmpd4A2AFR3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Frmpd4A2AFR3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Frmpd4A2AFR3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Frmpd4A2AFR3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Frmpd4A2AFR3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Frmpd4A2AFR3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Frmpd4A2AFR3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Frmpd4A2AFR3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Frmpd4A2AFR3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms