Protein–RNA interactions for Protein: A2A5E6

Znf385c, Zinc finger protein 385C, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf385cA2A5E6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Znf385cA2A5E6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Znf385cA2A5E6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Znf385cA2A5E6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Znf385cA2A5E6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Znf385cA2A5E6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Znf385cA2A5E6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Znf385cA2A5E6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Znf385cA2A5E6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Znf385cA2A5E6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Znf385cA2A5E6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Znf385cA2A5E6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Znf385cA2A5E6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Znf385cA2A5E6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Znf385cA2A5E6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Znf385cA2A5E6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Znf385cA2A5E6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Znf385cA2A5E6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Znf385cA2A5E6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Znf385cA2A5E6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Znf385cA2A5E6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Znf385cA2A5E6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Znf385cA2A5E6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Znf385cA2A5E6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Znf385cA2A5E6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Znf385cA2A5E6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Znf385cA2A5E6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Znf385cA2A5E6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Znf385cA2A5E6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Znf385cA2A5E6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Znf385cA2A5E6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Znf385cA2A5E6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Znf385cA2A5E6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Znf385cA2A5E6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Znf385cA2A5E6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Znf385cA2A5E6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Znf385cA2A5E6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Znf385cA2A5E6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Znf385cA2A5E6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Znf385cA2A5E6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Znf385cA2A5E6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Znf385cA2A5E6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Znf385cA2A5E6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Znf385cA2A5E6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Znf385cA2A5E6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Znf385cA2A5E6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Znf385cA2A5E6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Znf385cA2A5E6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Znf385cA2A5E6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Znf385cA2A5E6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Znf385cA2A5E6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Znf385cA2A5E6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Znf385cA2A5E6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Znf385cA2A5E6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Znf385cA2A5E6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Znf385cA2A5E6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Znf385cA2A5E6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Znf385cA2A5E6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Znf385cA2A5E6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Znf385cA2A5E6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Znf385cA2A5E6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Znf385cA2A5E6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Znf385cA2A5E6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Znf385cA2A5E6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Znf385cA2A5E6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Znf385cA2A5E6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Znf385cA2A5E6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Znf385cA2A5E6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Znf385cA2A5E6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Znf385cA2A5E6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Znf385cA2A5E6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Znf385cA2A5E6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Znf385cA2A5E6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Znf385cA2A5E6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Znf385cA2A5E6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Znf385cA2A5E6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Znf385cA2A5E6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Znf385cA2A5E6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Znf385cA2A5E6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Znf385cA2A5E6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Znf385cA2A5E6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Znf385cA2A5E6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Znf385cA2A5E6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Znf385cA2A5E6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Znf385cA2A5E6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Znf385cA2A5E6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Znf385cA2A5E6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Znf385cA2A5E6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Znf385cA2A5E6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Znf385cA2A5E6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Znf385cA2A5E6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Znf385cA2A5E6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Znf385cA2A5E6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Znf385cA2A5E6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Znf385cA2A5E6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Znf385cA2A5E6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Znf385cA2A5E6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Znf385cA2A5E6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Znf385cA2A5E6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Znf385cA2A5E6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms