Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GRH6

Zscan4-ps3, Zinc finger and SCAN domain containing 4, pseudogene 3, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
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