Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIT1

Ccdc194, Coiled-coil domain-containing protein 194, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc194A0A140LIT1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc194A0A140LIT1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc194A0A140LIT1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc194A0A140LIT1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc194A0A140LIT1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc194A0A140LIT1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc194A0A140LIT1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc194A0A140LIT1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc194A0A140LIT1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc194A0A140LIT1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ccdc194A0A140LIT1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc194A0A140LIT1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc194A0A140LIT1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc194A0A140LIT1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc194A0A140LIT1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc194A0A140LIT1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc194A0A140LIT1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc194A0A140LIT1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc194A0A140LIT1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc194A0A140LIT1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc194A0A140LIT1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc194A0A140LIT1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc194A0A140LIT1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc194A0A140LIT1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc194A0A140LIT1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc194A0A140LIT1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc194A0A140LIT1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc194A0A140LIT1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc194A0A140LIT1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc194A0A140LIT1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc194A0A140LIT1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc194A0A140LIT1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc194A0A140LIT1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc194A0A140LIT1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc194A0A140LIT1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc194A0A140LIT1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc194A0A140LIT1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc194A0A140LIT1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc194A0A140LIT1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc194A0A140LIT1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc194A0A140LIT1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc194A0A140LIT1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc194A0A140LIT1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc194A0A140LIT1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc194A0A140LIT1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc194A0A140LIT1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc194A0A140LIT1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc194A0A140LIT1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc194A0A140LIT1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc194A0A140LIT1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc194A0A140LIT1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc194A0A140LIT1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc194A0A140LIT1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc194A0A140LIT1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc194A0A140LIT1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc194A0A140LIT1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc194A0A140LIT1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc194A0A140LIT1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc194A0A140LIT1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc194A0A140LIT1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc194A0A140LIT1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc194A0A140LIT1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc194A0A140LIT1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc194A0A140LIT1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc194A0A140LIT1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc194A0A140LIT1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc194A0A140LIT1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc194A0A140LIT1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc194A0A140LIT1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc194A0A140LIT1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc194A0A140LIT1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc194A0A140LIT1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc194A0A140LIT1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc194A0A140LIT1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc194A0A140LIT1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc194A0A140LIT1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc194A0A140LIT1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc194A0A140LIT1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc194A0A140LIT1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc194A0A140LIT1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc194A0A140LIT1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc194A0A140LIT1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc194A0A140LIT1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc194A0A140LIT1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc194A0A140LIT1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc194A0A140LIT1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc194A0A140LIT1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc194A0A140LIT1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc194A0A140LIT1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc194A0A140LIT1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc194A0A140LIT1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc194A0A140LIT1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc194A0A140LIT1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc194A0A140LIT1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc194A0A140LIT1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc194A0A140LIT1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc194A0A140LIT1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc194A0A140LIT1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc194A0A140LIT1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc194A0A140LIT1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms