Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SVU1

Gm7298, Predicted gene 7298, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7298A0A0N4SVU1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Gm7298A0A0N4SVU1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Gm7298A0A0N4SVU1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Gm7298A0A0N4SVU1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Gm7298A0A0N4SVU1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Gm7298A0A0N4SVU1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Gm7298A0A0N4SVU1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
Gm7298A0A0N4SVU1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Gm7298A0A0N4SVU1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Gm7298A0A0N4SVU1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Gm7298A0A0N4SVU1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Gm7298A0A0N4SVU1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Gm7298A0A0N4SVU1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Gm7298A0A0N4SVU1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Gm7298A0A0N4SVU1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Gm7298A0A0N4SVU1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Gm7298A0A0N4SVU1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Gm7298A0A0N4SVU1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Gm7298A0A0N4SVU1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Gm7298A0A0N4SVU1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Gm7298A0A0N4SVU1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Gm7298A0A0N4SVU1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Gm7298A0A0N4SVU1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Gm7298A0A0N4SVU1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
Gm7298A0A0N4SVU1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Gm7298A0A0N4SVU1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
Gm7298A0A0N4SVU1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
Gm7298A0A0N4SVU1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Gm7298A0A0N4SVU1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Gm7298A0A0N4SVU1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
Gm7298A0A0N4SVU1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
Gm7298A0A0N4SVU1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
Gm7298A0A0N4SVU1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Gm7298A0A0N4SVU1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Gm7298A0A0N4SVU1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Gm7298A0A0N4SVU1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Gm7298A0A0N4SVU1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Gm7298A0A0N4SVU1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Gm7298A0A0N4SVU1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Gm7298A0A0N4SVU1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Gm7298A0A0N4SVU1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Gm7298A0A0N4SVU1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Gm7298A0A0N4SVU1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Gm7298A0A0N4SVU1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Gm7298A0A0N4SVU1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Gm7298A0A0N4SVU1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
Gm7298A0A0N4SVU1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Gm7298A0A0N4SVU1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Gm7298A0A0N4SVU1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
Gm7298A0A0N4SVU1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Gm7298A0A0N4SVU1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Gm7298A0A0N4SVU1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Gm7298A0A0N4SVU1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
Gm7298A0A0N4SVU1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
Gm7298A0A0N4SVU1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
Gm7298A0A0N4SVU1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
Gm7298A0A0N4SVU1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
Gm7298A0A0N4SVU1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Gm7298A0A0N4SVU1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Gm7298A0A0N4SVU1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Gm7298A0A0N4SVU1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Gm7298A0A0N4SVU1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
Gm7298A0A0N4SVU1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Gm7298A0A0N4SVU1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Gm7298A0A0N4SVU1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
Gm7298A0A0N4SVU1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Gm7298A0A0N4SVU1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Gm7298A0A0N4SVU1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
Gm7298A0A0N4SVU1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Gm7298A0A0N4SVU1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Gm7298A0A0N4SVU1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Gm7298A0A0N4SVU1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Gm7298A0A0N4SVU1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Gm7298A0A0N4SVU1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
Gm7298A0A0N4SVU1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Gm7298A0A0N4SVU1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Gm7298A0A0N4SVU1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Gm7298A0A0N4SVU1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Gm7298A0A0N4SVU1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Gm7298A0A0N4SVU1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Gm7298A0A0N4SVU1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Gm7298A0A0N4SVU1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Gm7298A0A0N4SVU1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Gm7298A0A0N4SVU1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
Gm7298A0A0N4SVU1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Gm7298A0A0N4SVU1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Gm7298A0A0N4SVU1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Gm7298A0A0N4SVU1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Gm7298A0A0N4SVU1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Gm7298A0A0N4SVU1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Gm7298A0A0N4SVU1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Gm7298A0A0N4SVU1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Gm7298A0A0N4SVU1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
Gm7298A0A0N4SVU1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Gm7298A0A0N4SVU1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Gm7298A0A0N4SVU1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Gm7298A0A0N4SVU1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Gm7298A0A0N4SVU1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Gm7298A0A0N4SVU1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Gm7298A0A0N4SVU1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 153.6 ms