Protein–RNA interactions for Protein: A0A0M3U1B0

Sycp2l, Synaptonemal complex protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2lA0A0M3U1B0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sycp2lA0A0M3U1B0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sycp2lA0A0M3U1B0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sycp2lA0A0M3U1B0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sycp2lA0A0M3U1B0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sycp2lA0A0M3U1B0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sycp2lA0A0M3U1B0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sycp2lA0A0M3U1B0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sycp2lA0A0M3U1B0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sycp2lA0A0M3U1B0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sycp2lA0A0M3U1B0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sycp2lA0A0M3U1B0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sycp2lA0A0M3U1B0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sycp2lA0A0M3U1B0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sycp2lA0A0M3U1B0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sycp2lA0A0M3U1B0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Sycp2lA0A0M3U1B0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sycp2lA0A0M3U1B0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sycp2lA0A0M3U1B0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sycp2lA0A0M3U1B0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sycp2lA0A0M3U1B0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sycp2lA0A0M3U1B0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sycp2lA0A0M3U1B0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sycp2lA0A0M3U1B0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sycp2lA0A0M3U1B0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sycp2lA0A0M3U1B0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sycp2lA0A0M3U1B0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sycp2lA0A0M3U1B0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sycp2lA0A0M3U1B0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sycp2lA0A0M3U1B0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sycp2lA0A0M3U1B0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sycp2lA0A0M3U1B0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Sycp2lA0A0M3U1B0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sycp2lA0A0M3U1B0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sycp2lA0A0M3U1B0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sycp2lA0A0M3U1B0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sycp2lA0A0M3U1B0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sycp2lA0A0M3U1B0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sycp2lA0A0M3U1B0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sycp2lA0A0M3U1B0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sycp2lA0A0M3U1B0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sycp2lA0A0M3U1B0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sycp2lA0A0M3U1B0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sycp2lA0A0M3U1B0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sycp2lA0A0M3U1B0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sycp2lA0A0M3U1B0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sycp2lA0A0M3U1B0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sycp2lA0A0M3U1B0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sycp2lA0A0M3U1B0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sycp2lA0A0M3U1B0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sycp2lA0A0M3U1B0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sycp2lA0A0M3U1B0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sycp2lA0A0M3U1B0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sycp2lA0A0M3U1B0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sycp2lA0A0M3U1B0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sycp2lA0A0M3U1B0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sycp2lA0A0M3U1B0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sycp2lA0A0M3U1B0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sycp2lA0A0M3U1B0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sycp2lA0A0M3U1B0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sycp2lA0A0M3U1B0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sycp2lA0A0M3U1B0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sycp2lA0A0M3U1B0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sycp2lA0A0M3U1B0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sycp2lA0A0M3U1B0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sycp2lA0A0M3U1B0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sycp2lA0A0M3U1B0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sycp2lA0A0M3U1B0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Sycp2lA0A0M3U1B0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sycp2lA0A0M3U1B0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sycp2lA0A0M3U1B0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sycp2lA0A0M3U1B0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sycp2lA0A0M3U1B0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sycp2lA0A0M3U1B0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sycp2lA0A0M3U1B0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sycp2lA0A0M3U1B0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sycp2lA0A0M3U1B0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms