Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P8

Trbv13-1, T cell receptor beta, variable 13-1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Trbv13-1A0A0B4J1P8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trbv13-1A0A0B4J1P8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trbv13-1A0A0B4J1P8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trbv13-1A0A0B4J1P8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trbv13-1A0A0B4J1P8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trbv13-1A0A0B4J1P8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trbv13-1A0A0B4J1P8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trbv13-1A0A0B4J1P8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trbv13-1A0A0B4J1P8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trbv13-1A0A0B4J1P8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trbv13-1A0A0B4J1P8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trbv13-1A0A0B4J1P8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trbv13-1A0A0B4J1P8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Trbv13-1A0A0B4J1P8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trbv13-1A0A0B4J1P8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms