Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WRV1

Vmn1r82, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r82A0A087WRV1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn1r82A0A087WRV1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn1r82A0A087WRV1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn1r82A0A087WRV1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn1r82A0A087WRV1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn1r82A0A087WRV1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn1r82A0A087WRV1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn1r82A0A087WRV1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn1r82A0A087WRV1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn1r82A0A087WRV1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn1r82A0A087WRV1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn1r82A0A087WRV1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn1r82A0A087WRV1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn1r82A0A087WRV1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r82A0A087WRV1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r82A0A087WRV1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r82A0A087WRV1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r82A0A087WRV1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r82A0A087WRV1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r82A0A087WRV1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r82A0A087WRV1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r82A0A087WRV1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r82A0A087WRV1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r82A0A087WRV1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r82A0A087WRV1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r82A0A087WRV1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vmn1r82A0A087WRV1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Vmn1r82A0A087WRV1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vmn1r82A0A087WRV1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vmn1r82A0A087WRV1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Vmn1r82A0A087WRV1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Vmn1r82A0A087WRV1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmn1r82A0A087WRV1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vmn1r82A0A087WRV1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vmn1r82A0A087WRV1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Vmn1r82A0A087WRV1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Vmn1r82A0A087WRV1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vmn1r82A0A087WRV1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Vmn1r82A0A087WRV1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmn1r82A0A087WRV1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmn1r82A0A087WRV1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmn1r82A0A087WRV1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmn1r82A0A087WRV1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmn1r82A0A087WRV1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmn1r82A0A087WRV1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmn1r82A0A087WRV1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmn1r82A0A087WRV1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vmn1r82A0A087WRV1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vmn1r82A0A087WRV1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vmn1r82A0A087WRV1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vmn1r82A0A087WRV1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vmn1r82A0A087WRV1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vmn1r82A0A087WRV1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vmn1r82A0A087WRV1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vmn1r82A0A087WRV1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vmn1r82A0A087WRV1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vmn1r82A0A087WRV1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vmn1r82A0A087WRV1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vmn1r82A0A087WRV1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Vmn1r82A0A087WRV1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vmn1r82A0A087WRV1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vmn1r82A0A087WRV1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vmn1r82A0A087WRV1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
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Vmn1r82A0A087WRV1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vmn1r82A0A087WRV1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vmn1r82A0A087WRV1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vmn1r82A0A087WRV1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vmn1r82A0A087WRV1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vmn1r82A0A087WRV1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vmn1r82A0A087WRV1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vmn1r82A0A087WRV1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vmn1r82A0A087WRV1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vmn1r82A0A087WRV1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vmn1r82A0A087WRV1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vmn1r82A0A087WRV1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vmn1r82A0A087WRV1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vmn1r82A0A087WRV1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vmn1r82A0A087WRV1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vmn1r82A0A087WRV1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Vmn1r82A0A087WRV1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vmn1r82A0A087WRV1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vmn1r82A0A087WRV1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vmn1r82A0A087WRV1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Vmn1r82A0A087WRV1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vmn1r82A0A087WRV1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vmn1r82A0A087WRV1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vmn1r82A0A087WRV1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vmn1r82A0A087WRV1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vmn1r82A0A087WRV1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vmn1r82A0A087WRV1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vmn1r82A0A087WRV1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vmn1r82A0A087WRV1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vmn1r82A0A087WRV1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vmn1r82A0A087WRV1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vmn1r82A0A087WRV1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vmn1r82A0A087WRV1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vmn1r82A0A087WRV1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vmn1r82A0A087WRV1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vmn1r82A0A087WRV1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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