Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WR25

Gm28360, Predicted gene 28360, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28360A0A087WR25 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm28360A0A087WR25 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm28360A0A087WR25 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm28360A0A087WR25 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm28360A0A087WR25 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm28360A0A087WR25 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm28360A0A087WR25 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm28360A0A087WR25 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm28360A0A087WR25 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm28360A0A087WR25 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm28360A0A087WR25 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm28360A0A087WR25 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm28360A0A087WR25 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm28360A0A087WR25 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm28360A0A087WR25 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm28360A0A087WR25 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm28360A0A087WR25 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm28360A0A087WR25 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm28360A0A087WR25 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm28360A0A087WR25 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm28360A0A087WR25 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm28360A0A087WR25 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gm28360A0A087WR25 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm28360A0A087WR25 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm28360A0A087WR25 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm28360A0A087WR25 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm28360A0A087WR25 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm28360A0A087WR25 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm28360A0A087WR25 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm28360A0A087WR25 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm28360A0A087WR25 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm28360A0A087WR25 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm28360A0A087WR25 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm28360A0A087WR25 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm28360A0A087WR25 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm28360A0A087WR25 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm28360A0A087WR25 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm28360A0A087WR25 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm28360A0A087WR25 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm28360A0A087WR25 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm28360A0A087WR25 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm28360A0A087WR25 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm28360A0A087WR25 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm28360A0A087WR25 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm28360A0A087WR25 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm28360A0A087WR25 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm28360A0A087WR25 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm28360A0A087WR25 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm28360A0A087WR25 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm28360A0A087WR25 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm28360A0A087WR25 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm28360A0A087WR25 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm28360A0A087WR25 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm28360A0A087WR25 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm28360A0A087WR25 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm28360A0A087WR25 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm28360A0A087WR25 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm28360A0A087WR25 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm28360A0A087WR25 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm28360A0A087WR25 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm28360A0A087WR25 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm28360A0A087WR25 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm28360A0A087WR25 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm28360A0A087WR25 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm28360A0A087WR25 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm28360A0A087WR25 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm28360A0A087WR25 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm28360A0A087WR25 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm28360A0A087WR25 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm28360A0A087WR25 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm28360A0A087WR25 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm28360A0A087WR25 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm28360A0A087WR25 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm28360A0A087WR25 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm28360A0A087WR25 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm28360A0A087WR25 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm28360A0A087WR25 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm28360A0A087WR25 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm28360A0A087WR25 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm28360A0A087WR25 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm28360A0A087WR25 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm28360A0A087WR25 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm28360A0A087WR25 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm28360A0A087WR25 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm28360A0A087WR25 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm28360A0A087WR25 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm28360A0A087WR25 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm28360A0A087WR25 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm28360A0A087WR25 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm28360A0A087WR25 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm28360A0A087WR25 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm28360A0A087WR25 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm28360A0A087WR25 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm28360A0A087WR25 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm28360A0A087WR25 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm28360A0A087WR25 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm28360A0A087WR25 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm28360A0A087WR25 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm28360A0A087WR25 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm28360A0A087WR25 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
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