Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY9

Ndufc1, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 subunit C1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufc1Q9CQY9 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ndufc1Q9CQY9 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 434.8 ms