Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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