Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnga1P29974 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms