Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RhoP15409 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RhoP15409 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RhoP15409 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RhoP15409 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RhoP15409 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RhoP15409 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RhoP15409 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RhoP15409 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RhoP15409 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RhoP15409 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RhoP15409 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RhoP15409 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RhoP15409 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RhoP15409 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RhoP15409 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RhoP15409 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RhoP15409 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RhoP15409 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RhoP15409 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RhoP15409 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RhoP15409 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RhoP15409 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RhoP15409 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RhoP15409 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RhoP15409 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RhoP15409 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RhoP15409 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RhoP15409 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RhoP15409 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RhoP15409 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RhoP15409 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RhoP15409 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RhoP15409 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RhoP15409 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RhoP15409 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RhoP15409 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RhoP15409 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RhoP15409 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RhoP15409 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RhoP15409 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RhoP15409 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RhoP15409 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RhoP15409 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RhoP15409 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RhoP15409 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RhoP15409 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RhoP15409 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RhoP15409 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RhoP15409 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RhoP15409 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RhoP15409 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RhoP15409 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RhoP15409 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RhoP15409 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RhoP15409 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RhoP15409 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RhoP15409 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RhoP15409 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RhoP15409 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RhoP15409 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RhoP15409 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RhoP15409 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RhoP15409 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RhoP15409 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RhoP15409 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RhoP15409 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RhoP15409 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RhoP15409 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RhoP15409 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RhoP15409 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RhoP15409 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RhoP15409 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RhoP15409 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RhoP15409 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RhoP15409 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RhoP15409 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RhoP15409 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RhoP15409 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RhoP15409 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RhoP15409 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RhoP15409 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RhoP15409 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RhoP15409 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RhoP15409 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RhoP15409 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RhoP15409 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RhoP15409 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RhoP15409 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RhoP15409 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RhoP15409 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RhoP15409 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RhoP15409 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RhoP15409 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RhoP15409 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RhoP15409 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RhoP15409 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RhoP15409 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RhoP15409 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RhoP15409 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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