Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms