Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5T0

Atad1, ATPase family AAA domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad1Q9D5T0 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Atad1Q9D5T0 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms