Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gps1Q99LD4 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms