Protein–RNA interactions for Protein: P41230

Kdm5c, Lysine-specific demethylase 5C, mousemouse

Predictions only

Length 1,554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5cP41230 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Kdm5cP41230 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Kdm5cP41230 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Kdm5cP41230 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Kdm5cP41230 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Kdm5cP41230 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Kdm5cP41230 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Kdm5cP41230 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kdm5cP41230 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kdm5cP41230 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kdm5cP41230 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm5cP41230 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm5cP41230 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm5cP41230 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm5cP41230 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm5cP41230 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm5cP41230 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm5cP41230 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm5cP41230 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm5cP41230 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm5cP41230 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm5cP41230 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm5cP41230 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm5cP41230 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm5cP41230 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm5cP41230 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm5cP41230 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm5cP41230 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm5cP41230 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm5cP41230 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm5cP41230 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm5cP41230 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm5cP41230 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm5cP41230 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm5cP41230 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm5cP41230 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm5cP41230 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm5cP41230 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm5cP41230 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm5cP41230 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm5cP41230 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm5cP41230 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm5cP41230 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm5cP41230 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm5cP41230 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm5cP41230 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm5cP41230 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm5cP41230 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm5cP41230 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm5cP41230 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm5cP41230 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm5cP41230 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm5cP41230 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm5cP41230 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm5cP41230 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm5cP41230 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm5cP41230 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm5cP41230 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm5cP41230 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm5cP41230 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm5cP41230 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm5cP41230 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm5cP41230 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm5cP41230 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm5cP41230 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm5cP41230 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm5cP41230 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm5cP41230 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm5cP41230 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm5cP41230 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm5cP41230 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm5cP41230 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm5cP41230 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm5cP41230 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm5cP41230 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm5cP41230 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm5cP41230 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm5cP41230 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm5cP41230 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm5cP41230 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm5cP41230 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm5cP41230 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm5cP41230 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm5cP41230 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm5cP41230 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm5cP41230 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm5cP41230 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm5cP41230 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm5cP41230 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm5cP41230 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm5cP41230 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm5cP41230 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm5cP41230 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm5cP41230 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm5cP41230 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm5cP41230 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm5cP41230 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm5cP41230 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm5cP41230 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm5cP41230 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms