Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms