Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms