Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG1

Edf1, Endothelial differentiation-related factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edf1Q9JMG1 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edf1Q9JMG1 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edf1Q9JMG1 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edf1Q9JMG1 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edf1Q9JMG1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edf1Q9JMG1 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edf1Q9JMG1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edf1Q9JMG1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edf1Q9JMG1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edf1Q9JMG1 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edf1Q9JMG1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edf1Q9JMG1 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edf1Q9JMG1 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edf1Q9JMG1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edf1Q9JMG1 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edf1Q9JMG1 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Edf1Q9JMG1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Edf1Q9JMG1 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Edf1Q9JMG1 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Edf1Q9JMG1 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Edf1Q9JMG1 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Edf1Q9JMG1 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Edf1Q9JMG1 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Edf1Q9JMG1 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Edf1Q9JMG1 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Edf1Q9JMG1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Edf1Q9JMG1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Edf1Q9JMG1 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Edf1Q9JMG1 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Edf1Q9JMG1 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Edf1Q9JMG1 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Edf1Q9JMG1 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Edf1Q9JMG1 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edf1Q9JMG1 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edf1Q9JMG1 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edf1Q9JMG1 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edf1Q9JMG1 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edf1Q9JMG1 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edf1Q9JMG1 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edf1Q9JMG1 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edf1Q9JMG1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edf1Q9JMG1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edf1Q9JMG1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edf1Q9JMG1 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edf1Q9JMG1 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edf1Q9JMG1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edf1Q9JMG1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edf1Q9JMG1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Edf1Q9JMG1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Edf1Q9JMG1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Edf1Q9JMG1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edf1Q9JMG1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Edf1Q9JMG1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edf1Q9JMG1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edf1Q9JMG1 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edf1Q9JMG1 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edf1Q9JMG1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edf1Q9JMG1 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edf1Q9JMG1 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edf1Q9JMG1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Edf1Q9JMG1 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Edf1Q9JMG1 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Edf1Q9JMG1 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Edf1Q9JMG1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Edf1Q9JMG1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Edf1Q9JMG1 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Edf1Q9JMG1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Edf1Q9JMG1 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Edf1Q9JMG1 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edf1Q9JMG1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edf1Q9JMG1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edf1Q9JMG1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edf1Q9JMG1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edf1Q9JMG1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edf1Q9JMG1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Edf1Q9JMG1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edf1Q9JMG1 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edf1Q9JMG1 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edf1Q9JMG1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edf1Q9JMG1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edf1Q9JMG1 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edf1Q9JMG1 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edf1Q9JMG1 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edf1Q9JMG1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edf1Q9JMG1 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edf1Q9JMG1 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edf1Q9JMG1 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edf1Q9JMG1 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edf1Q9JMG1 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Edf1Q9JMG1 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Edf1Q9JMG1 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Edf1Q9JMG1 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Edf1Q9JMG1 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Edf1Q9JMG1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Edf1Q9JMG1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Edf1Q9JMG1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Edf1Q9JMG1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Edf1Q9JMG1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Edf1Q9JMG1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Edf1Q9JMG1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms