Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIP3

4933424G06Rik, RIKEN cDNA 4933424G06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933424G06RikA0A140LIP3 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms