Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WPV9

1700019A02Rik, RIKEN cDNA 1700019A02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700019A02RikA0A087WPV9 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
1700019A02RikA0A087WPV9 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
1700019A02RikA0A087WPV9 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
1700019A02RikA0A087WPV9 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700019A02RikA0A087WPV9 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700019A02RikA0A087WPV9 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700019A02RikA0A087WPV9 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700019A02RikA0A087WPV9 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700019A02RikA0A087WPV9 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700019A02RikA0A087WPV9 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700019A02RikA0A087WPV9 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700019A02RikA0A087WPV9 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700019A02RikA0A087WPV9 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700019A02RikA0A087WPV9 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700019A02RikA0A087WPV9 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700019A02RikA0A087WPV9 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700019A02RikA0A087WPV9 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700019A02RikA0A087WPV9 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700019A02RikA0A087WPV9 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700019A02RikA0A087WPV9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700019A02RikA0A087WPV9 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700019A02RikA0A087WPV9 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700019A02RikA0A087WPV9 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700019A02RikA0A087WPV9 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700019A02RikA0A087WPV9 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700019A02RikA0A087WPV9 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700019A02RikA0A087WPV9 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
1700019A02RikA0A087WPV9 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
1700019A02RikA0A087WPV9 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
1700019A02RikA0A087WPV9 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
1700019A02RikA0A087WPV9 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
1700019A02RikA0A087WPV9 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
1700019A02RikA0A087WPV9 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
1700019A02RikA0A087WPV9 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
1700019A02RikA0A087WPV9 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
1700019A02RikA0A087WPV9 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
1700019A02RikA0A087WPV9 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
1700019A02RikA0A087WPV9 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
1700019A02RikA0A087WPV9 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
1700019A02RikA0A087WPV9 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
1700019A02RikA0A087WPV9 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
1700019A02RikA0A087WPV9 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
1700019A02RikA0A087WPV9 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
1700019A02RikA0A087WPV9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
1700019A02RikA0A087WPV9 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
1700019A02RikA0A087WPV9 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
1700019A02RikA0A087WPV9 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
1700019A02RikA0A087WPV9 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
1700019A02RikA0A087WPV9 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
1700019A02RikA0A087WPV9 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
1700019A02RikA0A087WPV9 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
1700019A02RikA0A087WPV9 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
1700019A02RikA0A087WPV9 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
1700019A02RikA0A087WPV9 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
1700019A02RikA0A087WPV9 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
1700019A02RikA0A087WPV9 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
1700019A02RikA0A087WPV9 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
1700019A02RikA0A087WPV9 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700019A02RikA0A087WPV9 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700019A02RikA0A087WPV9 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700019A02RikA0A087WPV9 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700019A02RikA0A087WPV9 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700019A02RikA0A087WPV9 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700019A02RikA0A087WPV9 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700019A02RikA0A087WPV9 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700019A02RikA0A087WPV9 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700019A02RikA0A087WPV9 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700019A02RikA0A087WPV9 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700019A02RikA0A087WPV9 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700019A02RikA0A087WPV9 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700019A02RikA0A087WPV9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700019A02RikA0A087WPV9 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700019A02RikA0A087WPV9 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700019A02RikA0A087WPV9 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700019A02RikA0A087WPV9 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700019A02RikA0A087WPV9 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700019A02RikA0A087WPV9 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700019A02RikA0A087WPV9 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700019A02RikA0A087WPV9 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700019A02RikA0A087WPV9 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700019A02RikA0A087WPV9 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700019A02RikA0A087WPV9 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700019A02RikA0A087WPV9 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 406.7 ms