Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAR7

Ssxb10, MCG68110, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb10Q6XAR7 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssxb10Q6XAR7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssxb10Q6XAR7 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssxb10Q6XAR7 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssxb10Q6XAR7 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssxb10Q6XAR7 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssxb10Q6XAR7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssxb10Q6XAR7 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssxb10Q6XAR7 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssxb10Q6XAR7 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssxb10Q6XAR7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssxb10Q6XAR7 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssxb10Q6XAR7 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssxb10Q6XAR7 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Ssxb10Q6XAR7 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Ssxb10Q6XAR7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssxb10Q6XAR7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
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Ssxb10Q6XAR7 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssxb10Q6XAR7 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssxb10Q6XAR7 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssxb10Q6XAR7 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssxb10Q6XAR7 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssxb10Q6XAR7 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssxb10Q6XAR7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssxb10Q6XAR7 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssxb10Q6XAR7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Ssxb10Q6XAR7 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssxb10Q6XAR7 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssxb10Q6XAR7 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssxb10Q6XAR7 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssxb10Q6XAR7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Ssxb10Q6XAR7 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Ssxb10Q6XAR7 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssxb10Q6XAR7 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Ssxb10Q6XAR7 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssxb10Q6XAR7 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Ssxb10Q6XAR7 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Ssxb10Q6XAR7 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Ssxb10Q6XAR7 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Ssxb10Q6XAR7 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssxb10Q6XAR7 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssxb10Q6XAR7 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssxb10Q6XAR7 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssxb10Q6XAR7 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssxb10Q6XAR7 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssxb10Q6XAR7 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssxb10Q6XAR7 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssxb10Q6XAR7 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssxb10Q6XAR7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssxb10Q6XAR7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssxb10Q6XAR7 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssxb10Q6XAR7 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssxb10Q6XAR7 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssxb10Q6XAR7 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssxb10Q6XAR7 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssxb10Q6XAR7 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssxb10Q6XAR7 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssxb10Q6XAR7 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssxb10Q6XAR7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssxb10Q6XAR7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssxb10Q6XAR7 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssxb10Q6XAR7 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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