Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms