Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RhoP15409 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RhoP15409 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RhoP15409 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RhoP15409 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RhoP15409 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RhoP15409 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RhoP15409 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RhoP15409 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RhoP15409 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RhoP15409 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RhoP15409 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RhoP15409 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RhoP15409 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RhoP15409 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RhoP15409 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RhoP15409 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RhoP15409 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RhoP15409 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RhoP15409 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RhoP15409 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RhoP15409 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RhoP15409 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RhoP15409 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RhoP15409 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RhoP15409 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RhoP15409 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RhoP15409 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RhoP15409 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RhoP15409 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RhoP15409 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RhoP15409 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RhoP15409 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RhoP15409 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RhoP15409 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RhoP15409 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RhoP15409 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RhoP15409 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RhoP15409 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RhoP15409 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RhoP15409 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RhoP15409 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RhoP15409 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RhoP15409 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RhoP15409 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RhoP15409 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RhoP15409 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RhoP15409 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RhoP15409 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RhoP15409 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RhoP15409 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RhoP15409 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RhoP15409 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RhoP15409 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RhoP15409 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RhoP15409 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RhoP15409 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RhoP15409 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RhoP15409 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RhoP15409 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RhoP15409 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RhoP15409 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RhoP15409 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RhoP15409 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RhoP15409 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RhoP15409 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RhoP15409 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RhoP15409 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RhoP15409 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RhoP15409 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RhoP15409 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RhoP15409 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RhoP15409 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RhoP15409 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RhoP15409 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RhoP15409 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RhoP15409 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RhoP15409 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RhoP15409 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RhoP15409 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RhoP15409 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RhoP15409 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RhoP15409 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RhoP15409 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RhoP15409 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RhoP15409 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RhoP15409 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RhoP15409 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RhoP15409 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RhoP15409 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RhoP15409 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RhoP15409 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RhoP15409 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RhoP15409 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RhoP15409 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RhoP15409 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RhoP15409 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RhoP15409 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RhoP15409 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RhoP15409 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms