Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIP3

4933424G06Rik, RIKEN cDNA 4933424G06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933424G06RikA0A140LIP3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16■□□□□ 0.15
4933424G06RikA0A140LIP3 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms