Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER39

Tor1a, Torsin-1A, mousemouse

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tor1aQ9ER39 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tor1aQ9ER39 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tor1aQ9ER39 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tor1aQ9ER39 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tor1aQ9ER39 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tor1aQ9ER39 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tor1aQ9ER39 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tor1aQ9ER39 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tor1aQ9ER39 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tor1aQ9ER39 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tor1aQ9ER39 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tor1aQ9ER39 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tor1aQ9ER39 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tor1aQ9ER39 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tor1aQ9ER39 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tor1aQ9ER39 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tor1aQ9ER39 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tor1aQ9ER39 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tor1aQ9ER39 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tor1aQ9ER39 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Tor1aQ9ER39 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tor1aQ9ER39 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tor1aQ9ER39 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tor1aQ9ER39 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tor1aQ9ER39 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tor1aQ9ER39 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tor1aQ9ER39 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tor1aQ9ER39 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Tor1aQ9ER39 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tor1aQ9ER39 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tor1aQ9ER39 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tor1aQ9ER39 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tor1aQ9ER39 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tor1aQ9ER39 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Tor1aQ9ER39 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Tor1aQ9ER39 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tor1aQ9ER39 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Tor1aQ9ER39 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tor1aQ9ER39 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Tor1aQ9ER39 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Tor1aQ9ER39 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Tor1aQ9ER39 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tor1aQ9ER39 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tor1aQ9ER39 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tor1aQ9ER39 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Tor1aQ9ER39 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tor1aQ9ER39 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tor1aQ9ER39 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tor1aQ9ER39 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tor1aQ9ER39 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tor1aQ9ER39 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tor1aQ9ER39 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tor1aQ9ER39 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tor1aQ9ER39 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tor1aQ9ER39 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tor1aQ9ER39 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tor1aQ9ER39 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tor1aQ9ER39 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tor1aQ9ER39 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tor1aQ9ER39 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Tor1aQ9ER39 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms