Protein–RNA interactions for Protein: Q14B02

Rnf133, E3 ubiquitin-protein ligase RNF133, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf133Q14B02 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rnf133Q14B02 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Rnf133Q14B02 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rnf133Q14B02 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rnf133Q14B02 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rnf133Q14B02 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rnf133Q14B02 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rnf133Q14B02 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rnf133Q14B02 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rnf133Q14B02 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rnf133Q14B02 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rnf133Q14B02 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rnf133Q14B02 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rnf133Q14B02 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rnf133Q14B02 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rnf133Q14B02 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rnf133Q14B02 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rnf133Q14B02 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rnf133Q14B02 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Rnf133Q14B02 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rnf133Q14B02 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rnf133Q14B02 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Rnf133Q14B02 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Rnf133Q14B02 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rnf133Q14B02 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rnf133Q14B02 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rnf133Q14B02 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rnf133Q14B02 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rnf133Q14B02 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rnf133Q14B02 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rnf133Q14B02 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Rnf133Q14B02 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rnf133Q14B02 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rnf133Q14B02 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rnf133Q14B02 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rnf133Q14B02 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rnf133Q14B02 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rnf133Q14B02 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rnf133Q14B02 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Rnf133Q14B02 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rnf133Q14B02 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rnf133Q14B02 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rnf133Q14B02 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rnf133Q14B02 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rnf133Q14B02 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rnf133Q14B02 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rnf133Q14B02 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rnf133Q14B02 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Rnf133Q14B02 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rnf133Q14B02 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rnf133Q14B02 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rnf133Q14B02 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rnf133Q14B02 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Rnf133Q14B02 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Rnf133Q14B02 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rnf133Q14B02 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rnf133Q14B02 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Rnf133Q14B02 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rnf133Q14B02 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rnf133Q14B02 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rnf133Q14B02 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rnf133Q14B02 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rnf133Q14B02 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rnf133Q14B02 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Rnf133Q14B02 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rnf133Q14B02 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rnf133Q14B02 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rnf133Q14B02 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rnf133Q14B02 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rnf133Q14B02 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rnf133Q14B02 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rnf133Q14B02 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rnf133Q14B02 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rnf133Q14B02 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rnf133Q14B02 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rnf133Q14B02 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rnf133Q14B02 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rnf133Q14B02 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rnf133Q14B02 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rnf133Q14B02 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rnf133Q14B02 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rnf133Q14B02 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rnf133Q14B02 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rnf133Q14B02 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rnf133Q14B02 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rnf133Q14B02 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rnf133Q14B02 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rnf133Q14B02 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rnf133Q14B02 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rnf133Q14B02 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rnf133Q14B02 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rnf133Q14B02 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rnf133Q14B02 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rnf133Q14B02 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rnf133Q14B02 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rnf133Q14B02 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rnf133Q14B02 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Rnf133Q14B02 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rnf133Q14B02 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rnf133Q14B02 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms