Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RhoP15409 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RhoP15409 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RhoP15409 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RhoP15409 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RhoP15409 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RhoP15409 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RhoP15409 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RhoP15409 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RhoP15409 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RhoP15409 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RhoP15409 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RhoP15409 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RhoP15409 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RhoP15409 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RhoP15409 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RhoP15409 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RhoP15409 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RhoP15409 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RhoP15409 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RhoP15409 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RhoP15409 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RhoP15409 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RhoP15409 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RhoP15409 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RhoP15409 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RhoP15409 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RhoP15409 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RhoP15409 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RhoP15409 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RhoP15409 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RhoP15409 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RhoP15409 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RhoP15409 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RhoP15409 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RhoP15409 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RhoP15409 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RhoP15409 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RhoP15409 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RhoP15409 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RhoP15409 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RhoP15409 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RhoP15409 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RhoP15409 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RhoP15409 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RhoP15409 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RhoP15409 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RhoP15409 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RhoP15409 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RhoP15409 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RhoP15409 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RhoP15409 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RhoP15409 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RhoP15409 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RhoP15409 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RhoP15409 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RhoP15409 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RhoP15409 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RhoP15409 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RhoP15409 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RhoP15409 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RhoP15409 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RhoP15409 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RhoP15409 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RhoP15409 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RhoP15409 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RhoP15409 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RhoP15409 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RhoP15409 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RhoP15409 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RhoP15409 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RhoP15409 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RhoP15409 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RhoP15409 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RhoP15409 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RhoP15409 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RhoP15409 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RhoP15409 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RhoP15409 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RhoP15409 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RhoP15409 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RhoP15409 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RhoP15409 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RhoP15409 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RhoP15409 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RhoP15409 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RhoP15409 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RhoP15409 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RhoP15409 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RhoP15409 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RhoP15409 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RhoP15409 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RhoP15409 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RhoP15409 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RhoP15409 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RhoP15409 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RhoP15409 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RhoP15409 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RhoP15409 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RhoP15409 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms