Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms