Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RhoP15409 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RhoP15409 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RhoP15409 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RhoP15409 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RhoP15409 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RhoP15409 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RhoP15409 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RhoP15409 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RhoP15409 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RhoP15409 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RhoP15409 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RhoP15409 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RhoP15409 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RhoP15409 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RhoP15409 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.14
RhoP15409 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RhoP15409 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RhoP15409 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RhoP15409 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RhoP15409 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RhoP15409 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RhoP15409 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RhoP15409 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RhoP15409 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RhoP15409 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RhoP15409 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RhoP15409 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RhoP15409 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RhoP15409 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RhoP15409 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RhoP15409 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RhoP15409 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RhoP15409 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RhoP15409 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RhoP15409 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RhoP15409 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RhoP15409 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RhoP15409 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RhoP15409 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RhoP15409 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RhoP15409 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RhoP15409 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RhoP15409 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RhoP15409 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RhoP15409 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RhoP15409 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RhoP15409 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RhoP15409 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RhoP15409 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RhoP15409 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RhoP15409 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RhoP15409 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RhoP15409 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RhoP15409 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RhoP15409 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RhoP15409 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RhoP15409 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RhoP15409 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RhoP15409 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RhoP15409 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RhoP15409 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RhoP15409 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RhoP15409 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RhoP15409 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RhoP15409 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RhoP15409 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RhoP15409 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RhoP15409 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RhoP15409 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RhoP15409 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RhoP15409 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RhoP15409 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RhoP15409 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RhoP15409 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RhoP15409 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RhoP15409 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RhoP15409 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RhoP15409 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RhoP15409 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RhoP15409 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RhoP15409 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RhoP15409 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RhoP15409 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RhoP15409 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RhoP15409 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RhoP15409 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RhoP15409 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RhoP15409 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RhoP15409 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RhoP15409 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RhoP15409 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RhoP15409 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RhoP15409 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RhoP15409 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RhoP15409 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RhoP15409 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RhoP15409 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RhoP15409 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RhoP15409 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms