Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG1

Edf1, Endothelial differentiation-related factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edf1Q9JMG1 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms