Protein–RNA interactions for Protein: Q7M732

Rtl1, Retrotransposon-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl1Q7M732 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Rtl1Q7M732 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Rtl1Q7M732 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rtl1Q7M732 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rtl1Q7M732 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rtl1Q7M732 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rtl1Q7M732 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rtl1Q7M732 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rtl1Q7M732 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rtl1Q7M732 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rtl1Q7M732 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rtl1Q7M732 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rtl1Q7M732 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rtl1Q7M732 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rtl1Q7M732 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rtl1Q7M732 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rtl1Q7M732 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Rtl1Q7M732 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Rtl1Q7M732 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Rtl1Q7M732 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Rtl1Q7M732 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Rtl1Q7M732 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Rtl1Q7M732 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Rtl1Q7M732 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Rtl1Q7M732 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rtl1Q7M732 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rtl1Q7M732 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rtl1Q7M732 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rtl1Q7M732 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rtl1Q7M732 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rtl1Q7M732 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rtl1Q7M732 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rtl1Q7M732 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rtl1Q7M732 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rtl1Q7M732 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rtl1Q7M732 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rtl1Q7M732 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rtl1Q7M732 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rtl1Q7M732 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rtl1Q7M732 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rtl1Q7M732 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rtl1Q7M732 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rtl1Q7M732 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rtl1Q7M732 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rtl1Q7M732 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rtl1Q7M732 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rtl1Q7M732 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rtl1Q7M732 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rtl1Q7M732 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rtl1Q7M732 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rtl1Q7M732 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rtl1Q7M732 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rtl1Q7M732 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rtl1Q7M732 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rtl1Q7M732 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rtl1Q7M732 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rtl1Q7M732 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rtl1Q7M732 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rtl1Q7M732 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rtl1Q7M732 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rtl1Q7M732 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rtl1Q7M732 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rtl1Q7M732 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rtl1Q7M732 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rtl1Q7M732 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rtl1Q7M732 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rtl1Q7M732 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rtl1Q7M732 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rtl1Q7M732 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rtl1Q7M732 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rtl1Q7M732 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rtl1Q7M732 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rtl1Q7M732 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rtl1Q7M732 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rtl1Q7M732 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rtl1Q7M732 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rtl1Q7M732 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rtl1Q7M732 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rtl1Q7M732 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rtl1Q7M732 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rtl1Q7M732 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rtl1Q7M732 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rtl1Q7M732 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rtl1Q7M732 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rtl1Q7M732 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rtl1Q7M732 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rtl1Q7M732 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Rtl1Q7M732 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rtl1Q7M732 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rtl1Q7M732 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rtl1Q7M732 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rtl1Q7M732 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rtl1Q7M732 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rtl1Q7M732 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rtl1Q7M732 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Rtl1Q7M732 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rtl1Q7M732 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rtl1Q7M732 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rtl1Q7M732 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rtl1Q7M732 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms