Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC12□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
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