Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG1

Edf1, Endothelial differentiation-related factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edf1Q9JMG1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Edf1Q9JMG1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Edf1Q9JMG1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Edf1Q9JMG1 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Edf1Q9JMG1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Edf1Q9JMG1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Edf1Q9JMG1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Edf1Q9JMG1 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Edf1Q9JMG1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Edf1Q9JMG1 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Edf1Q9JMG1 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Edf1Q9JMG1 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Edf1Q9JMG1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Edf1Q9JMG1 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Edf1Q9JMG1 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Edf1Q9JMG1 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.7 ms