Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
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NipblQ6KCD5 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
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NipblQ6KCD5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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NipblQ6KCD5 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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NipblQ6KCD5 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC12□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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