Protein–RNA interactions for Protein: P41230

Kdm5c, Lysine-specific demethylase 5C, mousemouse

Predictions only

Length 1,554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5cP41230 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kdm5cP41230 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kdm5cP41230 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Kdm5cP41230 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Kdm5cP41230 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kdm5cP41230 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kdm5cP41230 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kdm5cP41230 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kdm5cP41230 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Kdm5cP41230 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kdm5cP41230 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Kdm5cP41230 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Kdm5cP41230 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Kdm5cP41230 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm5cP41230 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm5cP41230 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm5cP41230 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm5cP41230 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm5cP41230 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm5cP41230 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm5cP41230 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm5cP41230 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm5cP41230 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm5cP41230 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm5cP41230 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm5cP41230 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm5cP41230 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm5cP41230 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm5cP41230 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm5cP41230 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm5cP41230 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm5cP41230 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm5cP41230 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm5cP41230 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm5cP41230 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm5cP41230 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm5cP41230 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm5cP41230 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm5cP41230 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm5cP41230 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm5cP41230 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kdm5cP41230 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Kdm5cP41230 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kdm5cP41230 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kdm5cP41230 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kdm5cP41230 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kdm5cP41230 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kdm5cP41230 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kdm5cP41230 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kdm5cP41230 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kdm5cP41230 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kdm5cP41230 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kdm5cP41230 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kdm5cP41230 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kdm5cP41230 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kdm5cP41230 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Kdm5cP41230 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kdm5cP41230 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm5cP41230 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm5cP41230 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm5cP41230 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm5cP41230 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm5cP41230 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm5cP41230 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm5cP41230 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm5cP41230 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm5cP41230 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm5cP41230 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm5cP41230 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm5cP41230 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm5cP41230 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm5cP41230 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm5cP41230 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm5cP41230 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm5cP41230 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm5cP41230 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm5cP41230 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm5cP41230 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm5cP41230 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm5cP41230 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm5cP41230 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm5cP41230 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm5cP41230 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm5cP41230 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm5cP41230 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm5cP41230 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm5cP41230 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm5cP41230 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm5cP41230 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm5cP41230 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm5cP41230 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm5cP41230 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm5cP41230 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm5cP41230 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm5cP41230 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm5cP41230 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm5cP41230 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm5cP41230 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm5cP41230 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm5cP41230 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms