Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cnga1P29974 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms