Protein–RNA interactions for Protein: V9GXJ1

Gm28036, Predicted gene, 28036, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28036V9GXJ1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm28036V9GXJ1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm28036V9GXJ1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm28036V9GXJ1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm28036V9GXJ1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm28036V9GXJ1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm28036V9GXJ1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm28036V9GXJ1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm28036V9GXJ1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm28036V9GXJ1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm28036V9GXJ1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm28036V9GXJ1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gm28036V9GXJ1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gm28036V9GXJ1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gm28036V9GXJ1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm28036V9GXJ1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm28036V9GXJ1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm28036V9GXJ1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm28036V9GXJ1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm28036V9GXJ1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm28036V9GXJ1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm28036V9GXJ1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm28036V9GXJ1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm28036V9GXJ1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm28036V9GXJ1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm28036V9GXJ1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm28036V9GXJ1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm28036V9GXJ1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm28036V9GXJ1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm28036V9GXJ1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm28036V9GXJ1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm28036V9GXJ1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm28036V9GXJ1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm28036V9GXJ1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Gm28036V9GXJ1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm28036V9GXJ1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm28036V9GXJ1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm28036V9GXJ1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm28036V9GXJ1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm28036V9GXJ1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm28036V9GXJ1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm28036V9GXJ1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm28036V9GXJ1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm28036V9GXJ1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm28036V9GXJ1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm28036V9GXJ1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm28036V9GXJ1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm28036V9GXJ1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm28036V9GXJ1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm28036V9GXJ1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm28036V9GXJ1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm28036V9GXJ1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm28036V9GXJ1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm28036V9GXJ1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm28036V9GXJ1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm28036V9GXJ1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm28036V9GXJ1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm28036V9GXJ1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm28036V9GXJ1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm28036V9GXJ1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm28036V9GXJ1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm28036V9GXJ1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm28036V9GXJ1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm28036V9GXJ1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm28036V9GXJ1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm28036V9GXJ1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm28036V9GXJ1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm28036V9GXJ1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm28036V9GXJ1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm28036V9GXJ1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm28036V9GXJ1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm28036V9GXJ1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm28036V9GXJ1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm28036V9GXJ1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm28036V9GXJ1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm28036V9GXJ1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm28036V9GXJ1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm28036V9GXJ1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm28036V9GXJ1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm28036V9GXJ1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm28036V9GXJ1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm28036V9GXJ1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm28036V9GXJ1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm28036V9GXJ1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm28036V9GXJ1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm28036V9GXJ1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm28036V9GXJ1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm28036V9GXJ1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm28036V9GXJ1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm28036V9GXJ1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm28036V9GXJ1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm28036V9GXJ1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm28036V9GXJ1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm28036V9GXJ1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm28036V9GXJ1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm28036V9GXJ1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm28036V9GXJ1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm28036V9GXJ1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm28036V9GXJ1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm28036V9GXJ1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms