Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Krt27Q9Z320 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Krt27Q9Z320 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krt27Q9Z320 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krt27Q9Z320 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krt27Q9Z320 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krt27Q9Z320 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krt27Q9Z320 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krt27Q9Z320 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krt27Q9Z320 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krt27Q9Z320 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krt27Q9Z320 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Krt27Q9Z320 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krt27Q9Z320 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krt27Q9Z320 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krt27Q9Z320 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krt27Q9Z320 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Krt27Q9Z320 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Krt27Q9Z320 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Krt27Q9Z320 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt27Q9Z320 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt27Q9Z320 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt27Q9Z320 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt27Q9Z320 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Krt27Q9Z320 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt27Q9Z320 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt27Q9Z320 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt27Q9Z320 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt27Q9Z320 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt27Q9Z320 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt27Q9Z320 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Krt27Q9Z320 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Krt27Q9Z320 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Krt27Q9Z320 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Krt27Q9Z320 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Krt27Q9Z320 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Krt27Q9Z320 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Krt27Q9Z320 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Krt27Q9Z320 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Krt27Q9Z320 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Krt27Q9Z320 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Krt27Q9Z320 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Krt27Q9Z320 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt27Q9Z320 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt27Q9Z320 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt27Q9Z320 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt27Q9Z320 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Krt27Q9Z320 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt27Q9Z320 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt27Q9Z320 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt27Q9Z320 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt27Q9Z320 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Krt27Q9Z320 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Krt27Q9Z320 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Krt27Q9Z320 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Krt27Q9Z320 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Krt27Q9Z320 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Krt27Q9Z320 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Krt27Q9Z320 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Krt27Q9Z320 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Krt27Q9Z320 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Krt27Q9Z320 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Krt27Q9Z320 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Krt27Q9Z320 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Krt27Q9Z320 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Krt27Q9Z320 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Krt27Q9Z320 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Krt27Q9Z320 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Krt27Q9Z320 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Krt27Q9Z320 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt27Q9Z320 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt27Q9Z320 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt27Q9Z320 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt27Q9Z320 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt27Q9Z320 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt27Q9Z320 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt27Q9Z320 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt27Q9Z320 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Krt27Q9Z320 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Krt27Q9Z320 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Krt27Q9Z320 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Krt27Q9Z320 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Krt27Q9Z320 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Krt27Q9Z320 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Krt27Q9Z320 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Krt27Q9Z320 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Krt27Q9Z320 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Krt27Q9Z320 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Krt27Q9Z320 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Krt27Q9Z320 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Krt27Q9Z320 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Krt27Q9Z320 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Krt27Q9Z320 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Krt27Q9Z320 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Krt27Q9Z320 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Krt27Q9Z320 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Krt27Q9Z320 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Krt27Q9Z320 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt27Q9Z320 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt27Q9Z320 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms