Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2H7

Gipc2, PDZ domain-containing protein GIPC2, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gipc2Q9Z2H7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gipc2Q9Z2H7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gipc2Q9Z2H7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gipc2Q9Z2H7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gipc2Q9Z2H7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gipc2Q9Z2H7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gipc2Q9Z2H7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gipc2Q9Z2H7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gipc2Q9Z2H7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gipc2Q9Z2H7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gipc2Q9Z2H7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Gipc2Q9Z2H7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gipc2Q9Z2H7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gipc2Q9Z2H7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gipc2Q9Z2H7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gipc2Q9Z2H7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Gipc2Q9Z2H7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gipc2Q9Z2H7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gipc2Q9Z2H7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gipc2Q9Z2H7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gipc2Q9Z2H7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gipc2Q9Z2H7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gipc2Q9Z2H7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gipc2Q9Z2H7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gipc2Q9Z2H7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gipc2Q9Z2H7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gipc2Q9Z2H7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gipc2Q9Z2H7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gipc2Q9Z2H7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gipc2Q9Z2H7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gipc2Q9Z2H7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gipc2Q9Z2H7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gipc2Q9Z2H7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gipc2Q9Z2H7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gipc2Q9Z2H7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gipc2Q9Z2H7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Gipc2Q9Z2H7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gipc2Q9Z2H7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gipc2Q9Z2H7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gipc2Q9Z2H7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gipc2Q9Z2H7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gipc2Q9Z2H7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Gipc2Q9Z2H7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gipc2Q9Z2H7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gipc2Q9Z2H7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gipc2Q9Z2H7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gipc2Q9Z2H7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Gipc2Q9Z2H7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gipc2Q9Z2H7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gipc2Q9Z2H7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gipc2Q9Z2H7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Gipc2Q9Z2H7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gipc2Q9Z2H7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gipc2Q9Z2H7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gipc2Q9Z2H7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gipc2Q9Z2H7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gipc2Q9Z2H7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gipc2Q9Z2H7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gipc2Q9Z2H7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gipc2Q9Z2H7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gipc2Q9Z2H7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gipc2Q9Z2H7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gipc2Q9Z2H7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Gipc2Q9Z2H7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gipc2Q9Z2H7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gipc2Q9Z2H7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gipc2Q9Z2H7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gipc2Q9Z2H7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gipc2Q9Z2H7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gipc2Q9Z2H7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gipc2Q9Z2H7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gipc2Q9Z2H7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gipc2Q9Z2H7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gipc2Q9Z2H7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gipc2Q9Z2H7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gipc2Q9Z2H7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gipc2Q9Z2H7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Gipc2Q9Z2H7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Gipc2Q9Z2H7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gipc2Q9Z2H7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gipc2Q9Z2H7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gipc2Q9Z2H7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gipc2Q9Z2H7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gipc2Q9Z2H7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gipc2Q9Z2H7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Gipc2Q9Z2H7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gipc2Q9Z2H7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Gipc2Q9Z2H7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gipc2Q9Z2H7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gipc2Q9Z2H7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gipc2Q9Z2H7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gipc2Q9Z2H7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gipc2Q9Z2H7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gipc2Q9Z2H7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gipc2Q9Z2H7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gipc2Q9Z2H7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gipc2Q9Z2H7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gipc2Q9Z2H7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gipc2Q9Z2H7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gipc2Q9Z2H7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms