Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z126

Pf4, Platelet factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pf4Q9Z126 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pf4Q9Z126 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pf4Q9Z126 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pf4Q9Z126 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pf4Q9Z126 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pf4Q9Z126 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pf4Q9Z126 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pf4Q9Z126 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pf4Q9Z126 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pf4Q9Z126 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pf4Q9Z126 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pf4Q9Z126 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pf4Q9Z126 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Pf4Q9Z126 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pf4Q9Z126 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pf4Q9Z126 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pf4Q9Z126 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pf4Q9Z126 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pf4Q9Z126 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pf4Q9Z126 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Pf4Q9Z126 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pf4Q9Z126 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pf4Q9Z126 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pf4Q9Z126 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pf4Q9Z126 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pf4Q9Z126 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pf4Q9Z126 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pf4Q9Z126 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pf4Q9Z126 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pf4Q9Z126 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pf4Q9Z126 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pf4Q9Z126 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pf4Q9Z126 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pf4Q9Z126 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pf4Q9Z126 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pf4Q9Z126 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pf4Q9Z126 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pf4Q9Z126 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pf4Q9Z126 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pf4Q9Z126 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pf4Q9Z126 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pf4Q9Z126 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pf4Q9Z126 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pf4Q9Z126 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pf4Q9Z126 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pf4Q9Z126 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pf4Q9Z126 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pf4Q9Z126 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pf4Q9Z126 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pf4Q9Z126 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pf4Q9Z126 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pf4Q9Z126 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pf4Q9Z126 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pf4Q9Z126 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pf4Q9Z126 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pf4Q9Z126 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pf4Q9Z126 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pf4Q9Z126 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pf4Q9Z126 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pf4Q9Z126 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pf4Q9Z126 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pf4Q9Z126 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pf4Q9Z126 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pf4Q9Z126 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pf4Q9Z126 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pf4Q9Z126 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pf4Q9Z126 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pf4Q9Z126 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pf4Q9Z126 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pf4Q9Z126 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pf4Q9Z126 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pf4Q9Z126 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pf4Q9Z126 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pf4Q9Z126 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pf4Q9Z126 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pf4Q9Z126 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pf4Q9Z126 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pf4Q9Z126 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pf4Q9Z126 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pf4Q9Z126 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pf4Q9Z126 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pf4Q9Z126 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pf4Q9Z126 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pf4Q9Z126 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pf4Q9Z126 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pf4Q9Z126 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pf4Q9Z126 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Pf4Q9Z126 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pf4Q9Z126 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pf4Q9Z126 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pf4Q9Z126 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pf4Q9Z126 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Pf4Q9Z126 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pf4Q9Z126 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pf4Q9Z126 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Pf4Q9Z126 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pf4Q9Z126 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pf4Q9Z126 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pf4Q9Z126 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pf4Q9Z126 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 143.7 ms