Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0T9

Itgb6, Integrin beta-6, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb6Q9Z0T9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Itgb6Q9Z0T9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itgb6Q9Z0T9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itgb6Q9Z0T9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itgb6Q9Z0T9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Itgb6Q9Z0T9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Itgb6Q9Z0T9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itgb6Q9Z0T9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itgb6Q9Z0T9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Itgb6Q9Z0T9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Itgb6Q9Z0T9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itgb6Q9Z0T9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itgb6Q9Z0T9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itgb6Q9Z0T9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Itgb6Q9Z0T9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itgb6Q9Z0T9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itgb6Q9Z0T9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Itgb6Q9Z0T9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Itgb6Q9Z0T9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Itgb6Q9Z0T9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itgb6Q9Z0T9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itgb6Q9Z0T9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itgb6Q9Z0T9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itgb6Q9Z0T9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itgb6Q9Z0T9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itgb6Q9Z0T9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itgb6Q9Z0T9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itgb6Q9Z0T9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itgb6Q9Z0T9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itgb6Q9Z0T9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itgb6Q9Z0T9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itgb6Q9Z0T9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itgb6Q9Z0T9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Itgb6Q9Z0T9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Itgb6Q9Z0T9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Itgb6Q9Z0T9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itgb6Q9Z0T9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itgb6Q9Z0T9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itgb6Q9Z0T9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itgb6Q9Z0T9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itgb6Q9Z0T9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itgb6Q9Z0T9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itgb6Q9Z0T9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itgb6Q9Z0T9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itgb6Q9Z0T9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itgb6Q9Z0T9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Itgb6Q9Z0T9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itgb6Q9Z0T9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itgb6Q9Z0T9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itgb6Q9Z0T9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itgb6Q9Z0T9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itgb6Q9Z0T9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itgb6Q9Z0T9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itgb6Q9Z0T9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itgb6Q9Z0T9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itgb6Q9Z0T9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itgb6Q9Z0T9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Itgb6Q9Z0T9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itgb6Q9Z0T9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itgb6Q9Z0T9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itgb6Q9Z0T9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itgb6Q9Z0T9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itgb6Q9Z0T9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Itgb6Q9Z0T9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itgb6Q9Z0T9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itgb6Q9Z0T9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itgb6Q9Z0T9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itgb6Q9Z0T9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Itgb6Q9Z0T9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Itgb6Q9Z0T9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itgb6Q9Z0T9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itgb6Q9Z0T9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itgb6Q9Z0T9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itgb6Q9Z0T9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itgb6Q9Z0T9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itgb6Q9Z0T9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itgb6Q9Z0T9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itgb6Q9Z0T9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itgb6Q9Z0T9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itgb6Q9Z0T9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itgb6Q9Z0T9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itgb6Q9Z0T9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itgb6Q9Z0T9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itgb6Q9Z0T9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itgb6Q9Z0T9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itgb6Q9Z0T9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itgb6Q9Z0T9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itgb6Q9Z0T9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itgb6Q9Z0T9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Itgb6Q9Z0T9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itgb6Q9Z0T9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itgb6Q9Z0T9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itgb6Q9Z0T9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itgb6Q9Z0T9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itgb6Q9Z0T9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itgb6Q9Z0T9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itgb6Q9Z0T9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itgb6Q9Z0T9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itgb6Q9Z0T9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itgb6Q9Z0T9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.6 ms