Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tnfsf13bQ9WU72 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tnfsf13bQ9WU72 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tnfsf13bQ9WU72 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tnfsf13bQ9WU72 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tnfsf13bQ9WU72 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tnfsf13bQ9WU72 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Tnfsf13bQ9WU72 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tnfsf13bQ9WU72 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tnfsf13bQ9WU72 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Tnfsf13bQ9WU72 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tnfsf13bQ9WU72 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Tnfsf13bQ9WU72 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tnfsf13bQ9WU72 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tnfsf13bQ9WU72 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tnfsf13bQ9WU72 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tnfsf13bQ9WU72 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tnfsf13bQ9WU72 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tnfsf13bQ9WU72 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tnfsf13bQ9WU72 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tnfsf13bQ9WU72 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tnfsf13bQ9WU72 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tnfsf13bQ9WU72 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tnfsf13bQ9WU72 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tnfsf13bQ9WU72 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tnfsf13bQ9WU72 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tnfsf13bQ9WU72 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tnfsf13bQ9WU72 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tnfsf13bQ9WU72 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tnfsf13bQ9WU72 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tnfsf13bQ9WU72 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tnfsf13bQ9WU72 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tnfsf13bQ9WU72 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tnfsf13bQ9WU72 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tnfsf13bQ9WU72 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tnfsf13bQ9WU72 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tnfsf13bQ9WU72 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Tnfsf13bQ9WU72 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tnfsf13bQ9WU72 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tnfsf13bQ9WU72 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Tnfsf13bQ9WU72 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tnfsf13bQ9WU72 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tnfsf13bQ9WU72 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tnfsf13bQ9WU72 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tnfsf13bQ9WU72 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Tnfsf13bQ9WU72 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tnfsf13bQ9WU72 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tnfsf13bQ9WU72 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tnfsf13bQ9WU72 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tnfsf13bQ9WU72 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tnfsf13bQ9WU72 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tnfsf13bQ9WU72 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tnfsf13bQ9WU72 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tnfsf13bQ9WU72 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tnfsf13bQ9WU72 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tnfsf13bQ9WU72 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tnfsf13bQ9WU72 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tnfsf13bQ9WU72 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tnfsf13bQ9WU72 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tnfsf13bQ9WU72 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Tnfsf13bQ9WU72 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tnfsf13bQ9WU72 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tnfsf13bQ9WU72 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tnfsf13bQ9WU72 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Tnfsf13bQ9WU72 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Tnfsf13bQ9WU72 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tnfsf13bQ9WU72 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Tnfsf13bQ9WU72 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Tnfsf13bQ9WU72 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tnfsf13bQ9WU72 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tnfsf13bQ9WU72 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tnfsf13bQ9WU72 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tnfsf13bQ9WU72 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tnfsf13bQ9WU72 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tnfsf13bQ9WU72 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tnfsf13bQ9WU72 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tnfsf13bQ9WU72 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tnfsf13bQ9WU72 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tnfsf13bQ9WU72 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Tnfsf13bQ9WU72 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Tnfsf13bQ9WU72 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tnfsf13bQ9WU72 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tnfsf13bQ9WU72 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tnfsf13bQ9WU72 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tnfsf13bQ9WU72 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tnfsf13bQ9WU72 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tnfsf13bQ9WU72 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tnfsf13bQ9WU72 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tnfsf13bQ9WU72 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tnfsf13bQ9WU72 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tnfsf13bQ9WU72 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tnfsf13bQ9WU72 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tnfsf13bQ9WU72 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tnfsf13bQ9WU72 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tnfsf13bQ9WU72 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tnfsf13bQ9WU72 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tnfsf13bQ9WU72 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tnfsf13bQ9WU72 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms