Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTP5

Cdh22, Cadherin-22, mousemouse

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh22Q9WTP5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdh22Q9WTP5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdh22Q9WTP5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdh22Q9WTP5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdh22Q9WTP5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdh22Q9WTP5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdh22Q9WTP5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdh22Q9WTP5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdh22Q9WTP5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdh22Q9WTP5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdh22Q9WTP5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdh22Q9WTP5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdh22Q9WTP5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdh22Q9WTP5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdh22Q9WTP5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdh22Q9WTP5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdh22Q9WTP5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdh22Q9WTP5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdh22Q9WTP5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdh22Q9WTP5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdh22Q9WTP5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdh22Q9WTP5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdh22Q9WTP5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdh22Q9WTP5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdh22Q9WTP5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdh22Q9WTP5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdh22Q9WTP5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdh22Q9WTP5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdh22Q9WTP5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdh22Q9WTP5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdh22Q9WTP5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdh22Q9WTP5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdh22Q9WTP5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdh22Q9WTP5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdh22Q9WTP5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdh22Q9WTP5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdh22Q9WTP5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdh22Q9WTP5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdh22Q9WTP5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdh22Q9WTP5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdh22Q9WTP5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdh22Q9WTP5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdh22Q9WTP5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Cdh22Q9WTP5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdh22Q9WTP5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdh22Q9WTP5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdh22Q9WTP5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdh22Q9WTP5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdh22Q9WTP5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdh22Q9WTP5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdh22Q9WTP5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdh22Q9WTP5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdh22Q9WTP5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdh22Q9WTP5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdh22Q9WTP5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdh22Q9WTP5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdh22Q9WTP5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdh22Q9WTP5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdh22Q9WTP5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdh22Q9WTP5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdh22Q9WTP5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdh22Q9WTP5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cdh22Q9WTP5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cdh22Q9WTP5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdh22Q9WTP5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdh22Q9WTP5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdh22Q9WTP5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdh22Q9WTP5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdh22Q9WTP5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdh22Q9WTP5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdh22Q9WTP5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdh22Q9WTP5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdh22Q9WTP5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdh22Q9WTP5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdh22Q9WTP5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdh22Q9WTP5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdh22Q9WTP5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdh22Q9WTP5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdh22Q9WTP5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdh22Q9WTP5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdh22Q9WTP5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdh22Q9WTP5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdh22Q9WTP5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdh22Q9WTP5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Cdh22Q9WTP5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdh22Q9WTP5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdh22Q9WTP5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdh22Q9WTP5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdh22Q9WTP5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdh22Q9WTP5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdh22Q9WTP5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdh22Q9WTP5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdh22Q9WTP5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdh22Q9WTP5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdh22Q9WTP5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdh22Q9WTP5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdh22Q9WTP5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdh22Q9WTP5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdh22Q9WTP5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdh22Q9WTP5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms