Protein–RNA interactions for Protein: Q9R210

Tfeb, Transcription factor EB, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfebQ9R210 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TfebQ9R210 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TfebQ9R210 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TfebQ9R210 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TfebQ9R210 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TfebQ9R210 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TfebQ9R210 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TfebQ9R210 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TfebQ9R210 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TfebQ9R210 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TfebQ9R210 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TfebQ9R210 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TfebQ9R210 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TfebQ9R210 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TfebQ9R210 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TfebQ9R210 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TfebQ9R210 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TfebQ9R210 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TfebQ9R210 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TfebQ9R210 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TfebQ9R210 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TfebQ9R210 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TfebQ9R210 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TfebQ9R210 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TfebQ9R210 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TfebQ9R210 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TfebQ9R210 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TfebQ9R210 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TfebQ9R210 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TfebQ9R210 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TfebQ9R210 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TfebQ9R210 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TfebQ9R210 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TfebQ9R210 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TfebQ9R210 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TfebQ9R210 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TfebQ9R210 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TfebQ9R210 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TfebQ9R210 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TfebQ9R210 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TfebQ9R210 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TfebQ9R210 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TfebQ9R210 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TfebQ9R210 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TfebQ9R210 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TfebQ9R210 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TfebQ9R210 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TfebQ9R210 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TfebQ9R210 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TfebQ9R210 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TfebQ9R210 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TfebQ9R210 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TfebQ9R210 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TfebQ9R210 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TfebQ9R210 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TfebQ9R210 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TfebQ9R210 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TfebQ9R210 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TfebQ9R210 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TfebQ9R210 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TfebQ9R210 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TfebQ9R210 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TfebQ9R210 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TfebQ9R210 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TfebQ9R210 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TfebQ9R210 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TfebQ9R210 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TfebQ9R210 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TfebQ9R210 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TfebQ9R210 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TfebQ9R210 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TfebQ9R210 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TfebQ9R210 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TfebQ9R210 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TfebQ9R210 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TfebQ9R210 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TfebQ9R210 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TfebQ9R210 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TfebQ9R210 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TfebQ9R210 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TfebQ9R210 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TfebQ9R210 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TfebQ9R210 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TfebQ9R210 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TfebQ9R210 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TfebQ9R210 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TfebQ9R210 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TfebQ9R210 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TfebQ9R210 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TfebQ9R210 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TfebQ9R210 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TfebQ9R210 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TfebQ9R210 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TfebQ9R210 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TfebQ9R210 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TfebQ9R210 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TfebQ9R210 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TfebQ9R210 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TfebQ9R210 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TfebQ9R210 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms