Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Q9

Atp6ap1, V-type proton ATPase subunit S1, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1Q9R1Q9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp6ap1Q9R1Q9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp6ap1Q9R1Q9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp6ap1Q9R1Q9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp6ap1Q9R1Q9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp6ap1Q9R1Q9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp6ap1Q9R1Q9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp6ap1Q9R1Q9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp6ap1Q9R1Q9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp6ap1Q9R1Q9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp6ap1Q9R1Q9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp6ap1Q9R1Q9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp6ap1Q9R1Q9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp6ap1Q9R1Q9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp6ap1Q9R1Q9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp6ap1Q9R1Q9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp6ap1Q9R1Q9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp6ap1Q9R1Q9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp6ap1Q9R1Q9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp6ap1Q9R1Q9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp6ap1Q9R1Q9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp6ap1Q9R1Q9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp6ap1Q9R1Q9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp6ap1Q9R1Q9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp6ap1Q9R1Q9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp6ap1Q9R1Q9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp6ap1Q9R1Q9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp6ap1Q9R1Q9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp6ap1Q9R1Q9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp6ap1Q9R1Q9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp6ap1Q9R1Q9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp6ap1Q9R1Q9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp6ap1Q9R1Q9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp6ap1Q9R1Q9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp6ap1Q9R1Q9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp6ap1Q9R1Q9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp6ap1Q9R1Q9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp6ap1Q9R1Q9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp6ap1Q9R1Q9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp6ap1Q9R1Q9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp6ap1Q9R1Q9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp6ap1Q9R1Q9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp6ap1Q9R1Q9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp6ap1Q9R1Q9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp6ap1Q9R1Q9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atp6ap1Q9R1Q9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp6ap1Q9R1Q9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp6ap1Q9R1Q9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp6ap1Q9R1Q9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp6ap1Q9R1Q9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp6ap1Q9R1Q9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp6ap1Q9R1Q9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp6ap1Q9R1Q9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp6ap1Q9R1Q9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp6ap1Q9R1Q9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp6ap1Q9R1Q9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp6ap1Q9R1Q9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp6ap1Q9R1Q9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp6ap1Q9R1Q9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp6ap1Q9R1Q9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp6ap1Q9R1Q9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp6ap1Q9R1Q9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp6ap1Q9R1Q9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp6ap1Q9R1Q9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp6ap1Q9R1Q9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp6ap1Q9R1Q9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp6ap1Q9R1Q9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp6ap1Q9R1Q9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp6ap1Q9R1Q9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp6ap1Q9R1Q9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp6ap1Q9R1Q9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp6ap1Q9R1Q9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms