Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0L1

Hsf4, Heat shock factor protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hsf4Q9R0L1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hsf4Q9R0L1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hsf4Q9R0L1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hsf4Q9R0L1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hsf4Q9R0L1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hsf4Q9R0L1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hsf4Q9R0L1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hsf4Q9R0L1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hsf4Q9R0L1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hsf4Q9R0L1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hsf4Q9R0L1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hsf4Q9R0L1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Hsf4Q9R0L1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hsf4Q9R0L1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Hsf4Q9R0L1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hsf4Q9R0L1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hsf4Q9R0L1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hsf4Q9R0L1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hsf4Q9R0L1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hsf4Q9R0L1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hsf4Q9R0L1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Hsf4Q9R0L1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hsf4Q9R0L1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hsf4Q9R0L1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hsf4Q9R0L1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hsf4Q9R0L1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hsf4Q9R0L1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hsf4Q9R0L1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hsf4Q9R0L1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hsf4Q9R0L1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Hsf4Q9R0L1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hsf4Q9R0L1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hsf4Q9R0L1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hsf4Q9R0L1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hsf4Q9R0L1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hsf4Q9R0L1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hsf4Q9R0L1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hsf4Q9R0L1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hsf4Q9R0L1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hsf4Q9R0L1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hsf4Q9R0L1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Hsf4Q9R0L1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hsf4Q9R0L1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hsf4Q9R0L1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hsf4Q9R0L1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Hsf4Q9R0L1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hsf4Q9R0L1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hsf4Q9R0L1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hsf4Q9R0L1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hsf4Q9R0L1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hsf4Q9R0L1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hsf4Q9R0L1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Hsf4Q9R0L1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Hsf4Q9R0L1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hsf4Q9R0L1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hsf4Q9R0L1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hsf4Q9R0L1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hsf4Q9R0L1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hsf4Q9R0L1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hsf4Q9R0L1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hsf4Q9R0L1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Hsf4Q9R0L1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hsf4Q9R0L1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hsf4Q9R0L1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hsf4Q9R0L1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hsf4Q9R0L1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hsf4Q9R0L1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hsf4Q9R0L1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hsf4Q9R0L1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hsf4Q9R0L1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hsf4Q9R0L1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hsf4Q9R0L1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hsf4Q9R0L1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hsf4Q9R0L1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Hsf4Q9R0L1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hsf4Q9R0L1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hsf4Q9R0L1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hsf4Q9R0L1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hsf4Q9R0L1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hsf4Q9R0L1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hsf4Q9R0L1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hsf4Q9R0L1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hsf4Q9R0L1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hsf4Q9R0L1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hsf4Q9R0L1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hsf4Q9R0L1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hsf4Q9R0L1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hsf4Q9R0L1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hsf4Q9R0L1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hsf4Q9R0L1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hsf4Q9R0L1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hsf4Q9R0L1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hsf4Q9R0L1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hsf4Q9R0L1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hsf4Q9R0L1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hsf4Q9R0L1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hsf4Q9R0L1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hsf4Q9R0L1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hsf4Q9R0L1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hsf4Q9R0L1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms