Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A1

Clcn2, Chloride channel protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn2Q9R0A1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clcn2Q9R0A1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clcn2Q9R0A1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clcn2Q9R0A1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clcn2Q9R0A1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clcn2Q9R0A1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clcn2Q9R0A1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clcn2Q9R0A1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clcn2Q9R0A1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clcn2Q9R0A1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clcn2Q9R0A1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clcn2Q9R0A1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clcn2Q9R0A1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clcn2Q9R0A1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clcn2Q9R0A1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clcn2Q9R0A1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clcn2Q9R0A1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clcn2Q9R0A1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clcn2Q9R0A1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Clcn2Q9R0A1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Clcn2Q9R0A1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Clcn2Q9R0A1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Clcn2Q9R0A1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Clcn2Q9R0A1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clcn2Q9R0A1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clcn2Q9R0A1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clcn2Q9R0A1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clcn2Q9R0A1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clcn2Q9R0A1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clcn2Q9R0A1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Clcn2Q9R0A1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clcn2Q9R0A1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clcn2Q9R0A1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clcn2Q9R0A1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clcn2Q9R0A1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clcn2Q9R0A1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clcn2Q9R0A1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clcn2Q9R0A1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clcn2Q9R0A1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Clcn2Q9R0A1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Clcn2Q9R0A1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clcn2Q9R0A1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clcn2Q9R0A1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clcn2Q9R0A1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clcn2Q9R0A1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clcn2Q9R0A1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clcn2Q9R0A1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clcn2Q9R0A1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clcn2Q9R0A1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clcn2Q9R0A1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clcn2Q9R0A1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clcn2Q9R0A1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clcn2Q9R0A1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clcn2Q9R0A1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clcn2Q9R0A1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Clcn2Q9R0A1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clcn2Q9R0A1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clcn2Q9R0A1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clcn2Q9R0A1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clcn2Q9R0A1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clcn2Q9R0A1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clcn2Q9R0A1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Clcn2Q9R0A1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clcn2Q9R0A1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clcn2Q9R0A1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clcn2Q9R0A1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clcn2Q9R0A1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clcn2Q9R0A1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clcn2Q9R0A1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clcn2Q9R0A1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clcn2Q9R0A1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clcn2Q9R0A1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clcn2Q9R0A1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clcn2Q9R0A1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clcn2Q9R0A1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clcn2Q9R0A1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clcn2Q9R0A1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clcn2Q9R0A1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clcn2Q9R0A1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clcn2Q9R0A1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clcn2Q9R0A1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clcn2Q9R0A1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clcn2Q9R0A1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clcn2Q9R0A1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clcn2Q9R0A1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clcn2Q9R0A1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clcn2Q9R0A1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clcn2Q9R0A1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Clcn2Q9R0A1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clcn2Q9R0A1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clcn2Q9R0A1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clcn2Q9R0A1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clcn2Q9R0A1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clcn2Q9R0A1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clcn2Q9R0A1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clcn2Q9R0A1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clcn2Q9R0A1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clcn2Q9R0A1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clcn2Q9R0A1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Clcn2Q9R0A1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.8 ms